

MarkerView™软件的直观界面专为非统计专业人员而设计,因此您可以专注于高价值的决策工作,例如在靶向/非靶向质谱工作流程中查看趋势和差异。 快速提取复杂的数据集,发现统计学上的显着差异并更快地给予关键解释。
发现MarkerView 软件1.3.1 新功能 >
强大 | 强大的统计工具,如主成分分析(PCA)、主成分变量分组(PCVG)和t检验。 | |
简单 | MarkerView软件使您能够通过直观的和交互式的图表来解释您的结果,找到重要的趋势和差异,让您更容易地得到答案。 | 查看我们的应用文章 > |
灵活 | 可以直接将SWATH®Acquisition 2.0、LipidView™软件、MasterView™软件或SCIEX OS软件得到的处理结果导入到MarkerView软件中,以生成有意义的结果。或者您可以直接使用MarkerView软件处理原始数据,以显示数据中显著不同的特性。 | 查看我们的应用文章 > |
LipidView软件可以有效识别和定量脂质。然后使用MarkerView软件中的主成分分析(PCA)可以可视化所有生物样本的脂质表达趋势,主成分变量分组(PCVG)可以根据其相似的定量分布聚类脂质。
MarkerView软件处理脂质数据的比较结果,该数据采集自TripleTOF™ 6600系统,三组磷脂和心磷脂样品的比较结果图(右图为载荷图,左图为得分图)。
进行未知筛查工作一般使用非数据依赖型扫描方法(IDA),允许研究人员在分析大量目标物的样本中找到差异。这个工作流程被应用在分析市售的40种啤酒之间的差异。
主成分分析(PCA):上图显示了不同类型样品中基于已知可量化特征中的PCA得分。啤酒是根据啤酒花的含量来区分的。在黑啤酒中发现 蛇麻酮(β-acids lupulone)和酒花烯二酮(adlupulone) 成分的浓度较高,下图为烈性黑啤酒和黑色IPA的轮廓图。这些数据采集自X500R QTOF系统。
为了加快生物学解释,先使用数据库检索快速鉴定代谢物,然后进行已知组分的主成分分析。采用简单的t检验分析并根据p值对差异代谢物进行排序。
在统计分析前可应用MasterView软件进行分析。可使用MasterView软件中的精确质量代谢组学谱库对代谢物进行鉴定和定量。下图数据为TripleTOF™5600+系统使用非信息依赖型SWATH®模式采集的数据,分析了Zucker大鼠模型的三种不同表型的血浆样本,根据其代谢谱将它们区分开。
使用SWATH Acquisition 2.0 系统对SWATH蛋白质组学数据进行深入分析,可确证和定量大量样品中的许多蛋白质和多肽。 然后将结果表直接导出到MarkerView软件进行PCA / PCVG和T检验等统计分析得到可视化结果。
SWATH蛋白组学数据的趋势分析。利用MarkerView软件中PCA分析根据结核杆菌(M. tuberculosis)不同生长状态 来确定差异蛋白,然后进行PCVG以确定相似的蛋白质,如载荷图(左)上的颜色所示。红圈为选择的每个PCVG组的代表性蛋白,右图为蛋白表达变化趋势(右图)。该数据为细菌蛋白提取物采集于TripleTOF™5600+系统。
我的实验室正在使用MarkerView 1.3.1软件分析处理应用 infusion MS/MSALL 流程得到的脂质组学数据。 MarkerView 软件是我们工作流程不可或缺的软件,我们使用它进行基本数据分析,PCA分析和脂质命名,或者通过数据导出功能进行更高级的数据分析。
~Jeff McDonald,
德克萨斯大学西南医学中心
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文档名称 |
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发布日期 |
发行说明 |
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03.29.17 | 发行说明 | 下载 | ||
MarkerView 1.3.1 Software License Terms | 03.01.17 | 下载 | ||
MarkerView 1.3 | 05.20.16 |
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MarkerView v1.3 Software License Terms | 04.01.16 |
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